第6回(平成20年度)

内閣総理大臣賞 「超高密度HDDのための高性能トンネル磁気抵抗素子の開発」

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科学技術政策担当大臣賞 「完全養殖クロマグロの産業化」

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文部科学大臣賞 「「高分解能三次元電子顕微鏡装置」の開発」

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文部科学大臣賞 「函館マリンバイオクラスター形成の推進」

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厚生労働大臣賞 「血栓性疾患関連酵素ADAMTS13の活性測定法の開発」

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経済産業大臣賞 「高精度がん放射線治療装置の開発」

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経済産業大臣賞 「「宮崎公設試発SPG技術」を活用した地域活性化」

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日本学術会議会長賞 「リアルタイム3次元顕微撮像システムの開発及び細胞内分子動態リアルタイム可視化研究」

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